龙8游戏官方进入上午九点钟,中科院国家科学图书馆(以下简称国科图)二楼协同交流研讨厅就坐满了中国科学院大学的研究生龙8long8,他们来自全国各地,有上海生化所的,有中科院沈阳自动化研究所的,还有成都生物研究所的,可谓天南地北。
此时,学生们正在紧张地等待中。“你说,咱们能获奖吗?”一个扎着马尾的女生拉了拉前面男生的衣服。“放心吧,没问题。”男生的话像一颗定心丸,让紧张的女生安静了下来。
这是由中科院国家科学图书馆和中国科学院大合主办的科研教育开放信息创新应用大赛颁奖典礼的现场。此次大赛旨在支持广大研究生利用开放数据开展科研或教育或社会生活等方面的创新,促进知识发现和知识应用,提高他们在数字环境下的创新能力,推动创新型教育的发展。
“我们的产品开发是基于我们自己的需求。”奖台上,来自中科院国家基因研究中心的研究生龚浩在向台下的观众推介他们的产品水稻基因注释浏览器。
水稻作为世界上最重要的粮食作物之一,一直以来是分子生物学重要的研究对象,关于水稻研究的相关数据非常之多,仅美国国立生物技术信息中心(NCBI)关于水稻的表达量芯片已经有8030张。
龚浩告诉《中国科学报》记者,在做产品之前,他们对很多人进行了调研,了解他们的需求以及一些应用偏好。
龚浩介绍,对于研究者来说,一方面他们迫切需要测序和芯片等数据提供有用的信息;而另一方面,由于公共数据库里面的数据分析过程太复杂,或者数据量大到在一般的服务器上根本无法处理,他们又很难获得这些数据信息。
基于此,龚浩团队设计特定程序对NCBI上的相关信息进行整合,提取出了2030张表达量芯片,极大地减少了查阅文献的工作量;使用者可以通过基因号查询水稻基因在2030张芯片中的表达信息,也可以检索在2030张芯片中和某个基因表达量最相关的前100个基因。
“我们产品最大的一个亮点在于首次同时整合水稻基因的功能注释信息、芯片表达量信息、同源基因比对信息和水稻基因组变异信息,这为水稻基因注释提供了一个统一的数据库平台。”龚浩说。
“当然可以。”龚浩说,他们的产品会授权在中科院和国科大范围内免费应用,同时也可以推广到其他农作物的育种应用上。
随后,参赛的学生们继续演示了其他的作品。按照作品功能划分,参赛作品包括科学研究、教育学习、信息检索分析、科研管理、公共生活娱乐等几类。而这些作品,都有一个共同特点。每个学生上来都会说,“我感受到的问题是什么,我的产品是要解决什么样的问题”。
来自计算所、数学所、自动化所、国科大计算机学院的方振鹏团队的“爱上课”产品,是基于中科院大学的选课系统弊端开发的一款产品,可以帮助学生实时查看课表以及上课时间,自2011年起,该产品就开始服务于国科大所有的学生,使用人数达4000多人。
中科院理论物理研究所潘瓒之所以开发“arXiv analytics”,也是因为他经常要使用arXiv网站查看论文和数据。介于网站功能的不方便,潘瓒对于arXiv的搜索条件进行了细化和进一步分类,以便于能够更好地进行检索。
中科院遥感与数字地球研究所林晖的产品“旅行咔”,旨在为旅行出游带来方便,他的产品可以实时发布PM2.5等相关天气数据,并告诉游人在哪里打车更加方便。
新颖实用的应用、方法及工具开发的背后,是学生们对各类开放数据和开放工具的有效使用,以及他们对于社会、科研以及教育中存在问题的敏感性和好奇心。
记者了解到,为支持研究生利用开放数据进行创新,国科图开放了自己的联合目录数据库、中国科学引文数据库、中国科学院机构知识库网络元数据库等八个数据库,并遴选和组织了全球科技、经济、文化、社会等方面的1600多个开放数据集。
“就算没获奖也没事,反正这东西我也经常用。”潘瓒的“arXiv analytics”获得了三等奖。
“整个大赛的过程中,我们心情都非常忐忑。”从担心没人参加,到担心学生能够做出来什么,到最后多少人能够交出来作品,中科院国家科学图书馆馆长张晓林用三个“忐忑”形容自己的心情。
而事实是,对于学生们的作品,来自多个领域的十几位专家给予了很高的评价。他们表示,在这么短的时间内产生了一批较为优秀的作品,作品超出预期,充分展示了中科院学生思路开阔、交叉融合和实践应用能力强等优势。
“假设有很多专门的团队去做这些,他们也许做不到像我们学生这样的深度。”对于学生们的出色表现,张晓林觉得很高兴。
中国科学院大学副校长苏刚说,此次活动是国科图与国科大支持“率先建成国家创新人才高地”的重要举措。“通过这次比赛,我们确实感受到这是一种非常好的研究生教育模式,对培养学生创新能力、项目设计实施能力、团队协作能力和展演能力都具有积极意义。”
对此,张晓林也非常认同。他指出,通过开放创新大赛这个机制,一方面把海量数字知识从图书馆和数据库中解放出来,变成研究生强大的创新武器;一方面也让开放数据和开放创新平台成为研究生的创新实验室,成为科研与教育创新的强大赋能器和培增器。
“和国科大一起做这个事情,不是我们一时的心血来潮,而是我们支持高水平创新人才培育和发展的新方向、新模式。”张晓林说。